La Secuenciación del Exoma Completo (WES) es una prueba utilizada para determinar la secuencia de ADN de un individuo y detectar trastornos genéticos.
¿Qué es la Secuenciación del Exoma Completo (WES)?
La Secuenciación del Exoma Completo (WES) es una técnica de Secuenciación de Nueva Generación (NGS) ampliamente utilizada en todo el mundo y en nuestro país, que consiste en secuenciar las "regiones codificantes de proteínas" del genoma. La secuenciación del exoma cubre todos los segmentos de ADN utilizados para la producción de proteínas en un ser humano. Aunque el "exoma humano" representa menos del 2% de todo el genoma, esta prueba incluye ~85% de las variantes asociadas con enfermedades conocidas en humanos.
La "secuenciación del exoma" se realiza para detectar variantes presentes en los exones. La secuenciación del exoma es una técnica utilizada para determinar el orden de la secuencia de ADN en el código genético de un individuo e identificar trastornos genéticos.
¿Cómo diagnosticamos una enfermedad genética? ¿Cuándo recomendamos la secuenciación del exoma?
Se utilizan diversos métodos para diagnosticar enfermedades genéticas.
- Primero, se recopila y documenta detalladamente la historia familiar y los antecedentes médicos personales del paciente.
- El análisis de la distribución de la enfermedad en el árbol genealógico es uno de los pasos cruciales en el diagnóstico.
- Posteriormente, se realiza un examen sistémico y una evaluación de las características dismórficas.
- Se revisan todas las pruebas realizadas previamente en otras clínicas.
Tras estas evaluaciones, cuando se considera un "diagnóstico preliminar", se planifican pruebas genéticas para el diagnóstico diferencial.
En esta etapa, si la enfermedad sospechada es:
Si se trata de una "enfermedad monogénica", los métodos moleculares cobran importancia. Si el diagnóstico es claro mediante el examen clínico y solo hay un gen conocido que causa la enfermedad, se planifica un estudio para ese gen. El método se elige en función del tipo de mutación que se observa con más frecuencia en la enfermedad sospechada. En algunas enfermedades, se prioriza la secuenciación del gen. A veces, se requiere un método llamado MLPA para investigar principalmente ganancias y pérdidas. Las decisiones se toman tras investigar los datos específicos de la enfermedad.
En los siguientes casos, el estudio de un solo gen no es suficiente:
- A veces el diagnóstico no es fácil. Los hallazgos clínicos pueden ser muy sutiles.
- Los hallazgos no son específicos de una enfermedad y pueden observarse en una gran variedad de condiciones.
- A veces la enfermedad está clara, pero hay muchos genes que pueden causarla (situaciones en las que el tipo no puede distinguirse mediante examen).
- El paciente tiene una enfermedad clara, pero presenta uno o más hallazgos adicionales que no pueden asociarse con ella. En otras palabras, puede haber más de una enfermedad presente.
En estos casos, es muy difícil diagnosticar mediante el estudio de un solo gen. Especialmente en las "enfermedades poligénicas", el análisis gen por gen resulta mucho más costoso y requiere más tiempo en comparación con las pruebas de gran escala como la "secuenciación del exoma".
En tales situaciones, se prefiere el método de SECUENCIACIÓN DEL EXOMA COMPLETO (WES), que secuencia las "regiones codificantes de proteínas" de los 20.000 genes.
¿Cuáles son las ventajas del método WES?
Si el paciente tiene múltiples enfermedades o una condición adicional que afecte la gravedad, permite diagnosticar todas ellas con una sola prueba.
Si el término "atípico" aparece con frecuencia en el expediente, suele haber una causa genética. Esto puede deberse a genes "modificadores" o a la coexistencia de múltiples enfermedades por una mutación adicional en un gen diferente. La secuenciación del exoma permite un diagnóstico completo de estas posibilidades.
Especialmente en nuestro país, donde el matrimonio consanguíneo es común, la tasa de múltiples enfermedades en un paciente no es baja. Estos resultados son cruciales para el cribado de futuros embarazos, identificando los genes portadores en ambos cónyuges.
Si los síntomas no son específicos, la secuenciación del exoma ofrece la oportunidad de diagnosticar analizando todos los genes.
¿Qué proporciona la Secuenciación del Exoma Completo (WES)?
WES es el proceso de determinar todas las regiones codificantes de ADN (exones). Las ventajas que proporciona son:
-
Diagnóstico de Enfermedades Genéticas:
Herramienta eficaz para identificar causas de enfermedades raras. -
Identificación de Factores de Riesgo:
Evalúa la probabilidad de enfermedades genéticas y es muy útil para el cribado pre-concepcional en casos de consanguinidad. -
Predicción de Respuesta a Fármacos:
Permite el desarrollo de la medicina personalizada (farmacogenómica). -
Investigación del Cáncer:
Análisis de cambios genéticos para personalizar las estrategias de tratamiento. -
Investigación y Descubrimientos Genéticos:
Descubrimiento de nuevos genes y comprensión de mecanismos genéticos.
¿Cómo se realiza la WES? ¿Cómo funciona el proceso?
La WES generalmente involucra los siguientes pasos:
-
Preparación de la Muestra de ADN:
- Extracción de ADN a partir de sangre, saliva o tejido.
- Obtención del material genético en laboratorio.
-
Enriquecimiento del Exoma (Captura):
- Aislamiento de exones mediante sondas específicas.
- Permite una secuenciación intensiva de las regiones exónicas.
-
Secuenciación:
- Lectura mediante tecnologías de alto rendimiento.
- Determinación y registro de pares de bases.
- Lectura simultánea de millones de pares de bases.
-
Análisis de Datos:
- Identificación bioinformática de variantes, mutaciones, inserciones y deleciones.
- Comparación con el genoma de referencia.
-
Interpretación e Informe:
- Evaluación clínica de la relevancia de las variantes.
- Interpretación por especialistas clínicos.
Evaluación de los Datos de Secuenciación del Exoma
La evaluación se realiza según los criterios del ACMG y hallazgos clínicos. Actualmente se asocian ~8.000 genes con enfermedades. Los resultados suelen tardar entre 1 y 2 meses.
ANÁLISIS: La experiencia es vital. Combinamos software propio con pericia clínica para lograr tasas de diagnóstico superiores a la media mundial.
EN RESUMEN;
- Permite determinar variantes en cualquier gen codificante.
- El objetivo es analizar ~20.000 genes a la vez, con menor costo y en menos tiempo.
Exoma Prenatal
Requiere mayor experiencia para detectar enfermedades fetales. El asesoramiento genético es obligatorio para cada informe.
Exoma en Trío
El estudio de madre-padre-hijo aumenta el éxito diagnóstico y acorta los tiempos, especialmente en el ámbito prenatal.